Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RCCD1A6NED2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCCD1A6NED2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms