Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT9

IKZF3, Zinc finger protein Aiolos, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3Q9UKT9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKZF3Q9UKT9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF3Q9UKT9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms