Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXD3Q9UJU5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD3Q9UJU5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms