Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJC17Q9NVM6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 718 ms