Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
INPP4AQ96PE3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INPP4AQ96PE3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INPP4AQ96PE3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms