Protein–RNA interactions for Protein: Q96MV1

TMEM56, Transmembrane protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM56Q96MV1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM56Q96MV1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM56Q96MV1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 903.8 ms