Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf48Q96LL4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.2 ms