Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms