Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HACE1Q8IYU2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACE1Q8IYU2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms