Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CASC2Q6XLA1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms