Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LETMD1Q6P1Q0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LETMD1Q6P1Q0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms