Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN1Q2MV58 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTN1Q2MV58 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTN1Q2MV58 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms