Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CA9Q16790 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CA9Q16790 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CA9Q16790 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA9Q16790 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CA9Q16790 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA9Q16790 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA9Q16790 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA9Q16790 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA9Q16790 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA9Q16790 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA9Q16790 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA9Q16790 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CA9Q16790 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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CA9Q16790 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CA9Q16790 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA9Q16790 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA9Q16790 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA9Q16790 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA9Q16790 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA9Q16790 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA9Q16790 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA9Q16790 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA9Q16790 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA9Q16790 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CA9Q16790 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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CA9Q16790 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CA9Q16790 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA9Q16790 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA9Q16790 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA9Q16790 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA9Q16790 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA9Q16790 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA9Q16790 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CA9Q16790 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA9Q16790 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA9Q16790 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CA9Q16790 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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