Protein–RNA interactions for Protein: Q15040

JOSD1, Josephin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JOSD1Q15040 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JOSD1Q15040 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JOSD1Q15040 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JOSD1Q15040 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JOSD1Q15040 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JOSD1Q15040 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JOSD1Q15040 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JOSD1Q15040 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
JOSD1Q15040 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JOSD1Q15040 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
JOSD1Q15040 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms