Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAPC2Q13487 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNAPC2Q13487 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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