Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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NPRL3Q12980 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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NPRL3Q12980 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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NPRL3Q12980 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NPRL3Q12980 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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NPRL3Q12980 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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NPRL3Q12980 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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NPRL3Q12980 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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NPRL3Q12980 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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NPRL3Q12980 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPRL3Q12980 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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