Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIRE1Q08AE8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms