Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC63Q05C16 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC63Q05C16 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms