Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCEQ02156 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCEQ02156 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCEQ02156 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms