Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3M2P53677 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms