Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB1P53618 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB1P53618 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COPB1P53618 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPB1P53618 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB1P53618 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB1P53618 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB1P53618 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB1P53618 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB1P53618 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB1P53618 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPB1P53618 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPB1P53618 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB1P53618 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB1P53618 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB1P53618 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB1P53618 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB1P53618 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB1P53618 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB1P53618 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB1P53618 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB1P53618 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPB1P53618 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB1P53618 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB1P53618 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB1P53618 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB1P53618 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB1P53618 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB1P53618 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB1P53618 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPB1P53618 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COPB1P53618 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COPB1P53618 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB1P53618 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB1P53618 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB1P53618 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB1P53618 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB1P53618 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB1P53618 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB1P53618 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPB1P53618 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPB1P53618 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPB1P53618 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB1P53618 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB1P53618 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB1P53618 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPB1P53618 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms