Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA6P31267 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms