Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SSFA2P28290 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms