Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1P11940 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PABPC1P11940 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1P11940 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms