Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms