Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFLP07196 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFLP07196 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFLP07196 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEFLP07196 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFLP07196 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFLP07196 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFLP07196 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFLP07196 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFLP07196 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFLP07196 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFLP07196 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFLP07196 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFLP07196 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEFLP07196 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFLP07196 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFLP07196 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFLP07196 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFLP07196 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFLP07196 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFLP07196 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFLP07196 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFLP07196 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEFLP07196 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEFLP07196 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFLP07196 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFLP07196 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NEFLP07196 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFLP07196 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFLP07196 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFLP07196 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFLP07196 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFLP07196 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFLP07196 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFLP07196 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFLP07196 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFLP07196 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFLP07196 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFLP07196 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFLP07196 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFLP07196 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFLP07196 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFLP07196 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFLP07196 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFLP07196 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFLP07196 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFLP07196 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFLP07196 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFLP07196 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFLP07196 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFLP07196 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms