Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms