Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RIMBP3BA6NNM3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
RIMBP3BA6NNM3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RIMBP3BA6NNM3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms