Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6L9A6NEM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms