Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO3A2RU48 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMCO3A2RU48 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms