Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PAXBP1Q9Y5B6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms