Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATXN7L1Q9ULK2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN7L1Q9ULK2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN7L1Q9ULK2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATXN7L1Q9ULK2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms