Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK12Q9NYV4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDK12Q9NYV4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDK12Q9NYV4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms