Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COA4Q9NYJ1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COA4Q9NYJ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms