Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC17Q9NVM6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJC17Q9NVM6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms