Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG6

PDRG1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDRG1Q9NUG6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PDRG1Q9NUG6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDRG1Q9NUG6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms