Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1BQ9H816 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCLRE1BQ9H816 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms