Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLSTN2Q9H4D0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.5 ms