Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSEN34Q9BSV6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSEN34Q9BSV6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms