Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF479Q96JC4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms