Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD5Q8TDI0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms