Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
PPARGC1BQ86YN6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PPARGC1BQ86YN6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PPARGC1BQ86YN6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PPARGC1BQ86YN6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PPARGC1BQ86YN6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.8 ms