Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HDXQ7Z353 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms