Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CASC2Q6XLA1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms