Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC62Q6P9F0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms