Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LYSMD4Q5XG99 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYSMD4Q5XG99 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYSMD4Q5XG99 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYSMD4Q5XG99 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYSMD4Q5XG99 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYSMD4Q5XG99 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYSMD4Q5XG99 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYSMD4Q5XG99 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYSMD4Q5XG99 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYSMD4Q5XG99 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms