Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLIPQ5VWP3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MLIPQ5VWP3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms