Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC93Q567U6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC93Q567U6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 483 ms