Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EXT1Q16394 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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EXT1Q16394 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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EXT1Q16394 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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EXT1Q16394 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EXT1Q16394 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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