Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SNCBQ16143 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNCBQ16143 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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